* Laboratório de Anatomia da Madeira
* Laboratório de Áreas Degradadas
* Laboratório de Beneficiamento
* Laboratório de Biodegradação
* Laboratório de Colheita de Madeira
* Laboratório de Dendrologia
* Laboratório de Dendrometria
* Laboratório do Departamento de Fitotecnia e Fitossanitarismo
* Laboratório do Departamento de Solos
* Laboratório de Ecofisiologia
* Laboratório de Economia
* Laboratório de Energia de Biomassa Florestal
* Laboratório de Estudos de Paisagem e Arborização Urbana
* Laboratório de Fauna
* Laboratório de Geoprocessamento
* Laboratório de Incêndios Florestais
* Laboratório de Informática
* Laboratório de Inventário Florestal
* Laboratório de Logística
* Laboratório de Manejo Florestal
* Laboratório de Melhoramento Florestal
* Laboratório de Micropropagação Vegetal
* Laboratório Neotropical de Controle Biológico de Plantas
* Laboratório de Painéis de Madeira
* Laboratório de Planejamento da Produção Florestal
* Laboratório de Polpa e Papel e Química da Madeira
* Laboratório de Preservação de Madeira
* Laboratório de Proteção Florestal
* Laboratório de Qualidade de Água
* Laboratório de Secagem
* Laboratório de Sementes e Controle de Qualidade de Mudas
* Laboratório de Sensoriamento Remoto
* Laboratório de Silvicultura
* Laboratório de Tecnologia da Madeira